Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23AP54725 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAD23AP54725 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD23AP54725 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD23AP54725 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD23AP54725 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD23AP54725 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms