Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRAP54198 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRAP54198 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRAP54198 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRAP54198 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
HIRAP54198 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HIRAP54198 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIRAP54198 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
HIRAP54198 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIRAP54198 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRAP54198 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRAP54198 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRAP54198 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRAP54198 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HIRAP54198 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HIRAP54198 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
HIRAP54198 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRAP54198 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRAP54198 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRAP54198 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRAP54198 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRAP54198 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRAP54198 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRAP54198 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRAP54198 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRAP54198 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRAP54198 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRAP54198 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRAP54198 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRAP54198 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRAP54198 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRAP54198 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRAP54198 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRAP54198 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIRAP54198 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
HIRAP54198 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HIRAP54198 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
HIRAP54198 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HIRAP54198 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRAP54198 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRAP54198 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRAP54198 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRAP54198 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRAP54198 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIRAP54198 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRAP54198 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRAP54198 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HIRAP54198 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRAP54198 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HIRAP54198 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRAP54198 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HIRAP54198 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRAP54198 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HIRAP54198 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HIRAP54198 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRAP54198 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
HIRAP54198 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRAP54198 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRAP54198 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRAP54198 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRAP54198 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HIRAP54198 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HIRAP54198 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRAP54198 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HIRAP54198 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HIRAP54198 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRAP54198 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HIRAP54198 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRAP54198 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HIRAP54198 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HIRAP54198 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIRAP54198 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HIRAP54198 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HIRAP54198 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HIRAP54198 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
HIRAP54198 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRAP54198 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HIRAP54198 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HIRAP54198 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HIRAP54198 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HIRAP54198 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HIRAP54198 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HIRAP54198 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRAP54198 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRAP54198 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRAP54198 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRAP54198 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRAP54198 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRAP54198 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRAP54198 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms