Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA3P52797 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA3P52797 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNA3P52797 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFNA3P52797 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EFNA3P52797 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFNA3P52797 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms