Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RND2P52198 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RND2P52198 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RND2P52198 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RND2P52198 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RND2P52198 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RND2P52198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RND2P52198 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RND2P52198 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RND2P52198 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RND2P52198 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RND2P52198 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RND2P52198 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RND2P52198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RND2P52198 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RND2P52198 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RND2P52198 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RND2P52198 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RND2P52198 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RND2P52198 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RND2P52198 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RND2P52198 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RND2P52198 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RND2P52198 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RND2P52198 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RND2P52198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RND2P52198 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RND2P52198 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RND2P52198 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RND2P52198 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RND2P52198 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RND2P52198 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RND2P52198 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RND2P52198 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RND2P52198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RND2P52198 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RND2P52198 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RND2P52198 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RND2P52198 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RND2P52198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RND2P52198 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RND2P52198 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RND2P52198 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RND2P52198 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RND2P52198 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RND2P52198 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RND2P52198 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RND2P52198 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RND2P52198 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RND2P52198 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RND2P52198 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RND2P52198 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RND2P52198 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RND2P52198 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RND2P52198 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RND2P52198 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RND2P52198 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RND2P52198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RND2P52198 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RND2P52198 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RND2P52198 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RND2P52198 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RND2P52198 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RND2P52198 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RND2P52198 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RND2P52198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RND2P52198 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RND2P52198 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RND2P52198 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RND2P52198 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RND2P52198 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RND2P52198 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RND2P52198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RND2P52198 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RND2P52198 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RND2P52198 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RND2P52198 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RND2P52198 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RND2P52198 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RND2P52198 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RND2P52198 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RND2P52198 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RND2P52198 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RND2P52198 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RND2P52198 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RND2P52198 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RND2P52198 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RND2P52198 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RND2P52198 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RND2P52198 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RND2P52198 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RND2P52198 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RND2P52198 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms