Protein–RNA interactions for Protein: P51684

CCR6, C-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6P51684 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR6P51684 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR6P51684 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR6P51684 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR6P51684 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR6P51684 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR6P51684 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR6P51684 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR6P51684 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR6P51684 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR6P51684 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR6P51684 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR6P51684 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR6P51684 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR6P51684 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR6P51684 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR6P51684 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR6P51684 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR6P51684 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR6P51684 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR6P51684 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR6P51684 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR6P51684 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR6P51684 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR6P51684 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR6P51684 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR6P51684 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR6P51684 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR6P51684 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR6P51684 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR6P51684 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR6P51684 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR6P51684 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR6P51684 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR6P51684 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR6P51684 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR6P51684 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR6P51684 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR6P51684 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR6P51684 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR6P51684 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR6P51684 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR6P51684 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR6P51684 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR6P51684 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR6P51684 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR6P51684 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR6P51684 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR6P51684 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR6P51684 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR6P51684 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR6P51684 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR6P51684 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR6P51684 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR6P51684 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR6P51684 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR6P51684 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR6P51684 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR6P51684 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR6P51684 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR6P51684 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR6P51684 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR6P51684 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR6P51684 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR6P51684 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR6P51684 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR6P51684 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR6P51684 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR6P51684 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR6P51684 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR6P51684 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR6P51684 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR6P51684 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR6P51684 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR6P51684 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR6P51684 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR6P51684 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR6P51684 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR6P51684 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR6P51684 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR6P51684 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR6P51684 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR6P51684 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR6P51684 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR6P51684 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR6P51684 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR6P51684 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR6P51684 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR6P51684 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR6P51684 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR6P51684 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR6P51684 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR6P51684 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR6P51684 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR6P51684 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR6P51684 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR6P51684 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR6P51684 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR6P51684 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR6P51684 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms