Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2D1P51668 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2D1P51668 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D1P51668 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2D1P51668 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2D1P51668 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms