Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
SMARCA4P51532 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.38
SMARCA4P51532 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
SMARCA4P51532 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
SMARCA4P51532 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
SMARCA4P51532 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
SMARCA4P51532 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
SMARCA4P51532 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC48.64■■■■■ 5.38
SMARCA4P51532 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
SMARCA4P51532 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
SMARCA4P51532 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
SMARCA4P51532 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC48.5■■■■■ 5.36
SMARCA4P51532 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.5■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC48.5■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.5■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC48.46■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC48.46■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC48.45■■■■■ 5.35
SMARCA4P51532 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC48.43■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC48.42■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC48.39■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
SMARCA4P51532 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC48.36■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
SMARCA4P51532 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.31■■■■■ 5.32
SMARCA4P51532 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
SMARCA4P51532 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
SMARCA4P51532 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
SMARCA4P51532 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
SMARCA4P51532 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC48.26■■■■■ 5.32
SMARCA4P51532 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.32
SMARCA4P51532 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
SMARCA4P51532 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
SMARCA4P51532 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
SMARCA4P51532 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
SMARCA4P51532 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC48.21■■■■■ 5.31
SMARCA4P51532 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA4P51532 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SMARCA4P51532 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC48.16■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC48.14■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
SMARCA4P51532 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC48.11■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC48.11■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC48.09■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC48.08■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
SMARCA4P51532 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
SMARCA4P51532 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC47.99■■■■■ 5.27
SMARCA4P51532 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC47.97■■■■■ 5.27
SMARCA4P51532 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
SMARCA4P51532 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC47.95■■■■■ 5.27
SMARCA4P51532 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
SMARCA4P51532 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
SMARCA4P51532 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
SMARCA4P51532 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
SMARCA4P51532 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA4P51532 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
SMARCA4P51532 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms