Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MMP16P51512 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP16P51512 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP16P51512 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP16P51512 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP16P51512 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP16P51512 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP16P51512 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP16P51512 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMP16P51512 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP16P51512 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP16P51512 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP16P51512 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP16P51512 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP16P51512 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP16P51512 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP16P51512 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP16P51512 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP16P51512 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP16P51512 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP16P51512 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP16P51512 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP16P51512 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP16P51512 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP16P51512 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP16P51512 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP16P51512 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP16P51512 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP16P51512 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP16P51512 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP16P51512 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP16P51512 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP16P51512 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP16P51512 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP16P51512 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP16P51512 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP16P51512 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP16P51512 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP16P51512 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP16P51512 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP16P51512 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP16P51512 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP16P51512 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP16P51512 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP16P51512 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP16P51512 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP16P51512 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP16P51512 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP16P51512 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP16P51512 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP16P51512 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP16P51512 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP16P51512 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP16P51512 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP16P51512 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP16P51512 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP16P51512 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP16P51512 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP16P51512 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP16P51512 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP16P51512 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP16P51512 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP16P51512 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP16P51512 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP16P51512 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP16P51512 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP16P51512 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP16P51512 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP16P51512 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP16P51512 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP16P51512 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP16P51512 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP16P51512 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP16P51512 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP16P51512 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP16P51512 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP16P51512 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP16P51512 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP16P51512 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP16P51512 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP16P51512 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP16P51512 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP16P51512 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP16P51512 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP16P51512 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP16P51512 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP16P51512 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP16P51512 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP16P51512 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP16P51512 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP16P51512 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP16P51512 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP16P51512 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP16P51512 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP16P51512 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP16P51512 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP16P51512 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP16P51512 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP16P51512 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP16P51512 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms