Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK9P50750 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK9P50750 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK9P50750 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK9P50750 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK9P50750 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK9P50750 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK9P50750 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK9P50750 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK9P50750 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK9P50750 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK9P50750 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK9P50750 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK9P50750 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK9P50750 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK9P50750 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDK9P50750 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK9P50750 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK9P50750 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK9P50750 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK9P50750 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK9P50750 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK9P50750 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK9P50750 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK9P50750 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK9P50750 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK9P50750 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK9P50750 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK9P50750 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK9P50750 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK9P50750 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK9P50750 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK9P50750 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK9P50750 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK9P50750 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK9P50750 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK9P50750 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK9P50750 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK9P50750 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK9P50750 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK9P50750 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK9P50750 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK9P50750 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK9P50750 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK9P50750 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK9P50750 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK9P50750 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK9P50750 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK9P50750 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK9P50750 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK9P50750 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK9P50750 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK9P50750 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK9P50750 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK9P50750 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK9P50750 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK9P50750 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK9P50750 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK9P50750 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK9P50750 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK9P50750 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK9P50750 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK9P50750 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK9P50750 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK9P50750 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK9P50750 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK9P50750 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK9P50750 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK9P50750 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK9P50750 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK9P50750 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK9P50750 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK9P50750 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK9P50750 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK9P50750 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK9P50750 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK9P50750 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK9P50750 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK9P50750 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK9P50750 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK9P50750 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK9P50750 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK9P50750 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK9P50750 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK9P50750 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK9P50750 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK9P50750 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK9P50750 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK9P50750 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK9P50750 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK9P50750 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK9P50750 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK9P50750 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms