Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CDK7P50613 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK7P50613 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK7P50613 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK7P50613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK7P50613 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDK7P50613 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK7P50613 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK7P50613 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK7P50613 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK7P50613 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDK7P50613 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK7P50613 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK7P50613 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDK7P50613 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK7P50613 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK7P50613 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK7P50613 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK7P50613 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK7P50613 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK7P50613 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK7P50613 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDK7P50613 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK7P50613 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CDK7P50613 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK7P50613 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CDK7P50613 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK7P50613 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK7P50613 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDK7P50613 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDK7P50613 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK7P50613 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK7P50613 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK7P50613 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK7P50613 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK7P50613 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK7P50613 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK7P50613 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK7P50613 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK7P50613 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK7P50613 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK7P50613 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK7P50613 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK7P50613 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK7P50613 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK7P50613 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK7P50613 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK7P50613 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK7P50613 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDK7P50613 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK7P50613 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK7P50613 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK7P50613 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK7P50613 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK7P50613 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK7P50613 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK7P50613 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK7P50613 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK7P50613 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK7P50613 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK7P50613 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK7P50613 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK7P50613 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK7P50613 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK7P50613 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK7P50613 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK7P50613 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK7P50613 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK7P50613 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK7P50613 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK7P50613 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK7P50613 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK7P50613 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK7P50613 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK7P50613 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK7P50613 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK7P50613 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK7P50613 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK7P50613 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK7P50613 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK7P50613 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK7P50613 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK7P50613 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK7P50613 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK7P50613 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK7P50613 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK7P50613 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK7P50613 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK7P50613 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK7P50613 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK7P50613 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK7P50613 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms