Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV1P50549 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV1P50549 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV1P50549 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ETV1P50549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETV1P50549 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETV1P50549 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ETV1P50549 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV1P50549 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV1P50549 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ETV1P50549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV1P50549 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ETV1P50549 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV1P50549 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV1P50549 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV1P50549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV1P50549 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV1P50549 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ETV1P50549 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV1P50549 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ETV1P50549 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV1P50549 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV1P50549 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV1P50549 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ETV1P50549 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV1P50549 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV1P50549 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV1P50549 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ETV1P50549 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ETV1P50549 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ETV1P50549 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ETV1P50549 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ETV1P50549 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ETV1P50549 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ETV1P50549 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ETV1P50549 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ETV1P50549 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ETV1P50549 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ETV1P50549 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ETV1P50549 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ETV1P50549 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ETV1P50549 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ETV1P50549 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ETV1P50549 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ETV1P50549 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV1P50549 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV1P50549 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV1P50549 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV1P50549 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV1P50549 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV1P50549 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ETV1P50549 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV1P50549 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV1P50549 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV1P50549 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV1P50549 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV1P50549 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ETV1P50549 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV1P50549 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV1P50549 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV1P50549 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ETV1P50549 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETV1P50549 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ETV1P50549 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV1P50549 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV1P50549 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETV1P50549 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETV1P50549 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV1P50549 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV1P50549 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV1P50549 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ETV1P50549 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV1P50549 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV1P50549 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETV1P50549 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETV1P50549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETV1P50549 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ETV1P50549 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV1P50549 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV1P50549 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV1P50549 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV1P50549 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV1P50549 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV1P50549 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETV1P50549 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV1P50549 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV1P50549 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV1P50549 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETV1P50549 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV1P50549 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV1P50549 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV1P50549 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV1P50549 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV1P50549 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETV1P50549 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV1P50549 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV1P50549 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV1P50549 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV1P50549 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETV1P50549 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms