Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP4P49662 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP4P49662 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP4P49662 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP4P49662 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP4P49662 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP4P49662 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP4P49662 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP4P49662 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP4P49662 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP4P49662 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP4P49662 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP4P49662 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP4P49662 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP4P49662 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP4P49662 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP4P49662 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP4P49662 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP4P49662 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP4P49662 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP4P49662 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP4P49662 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP4P49662 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP4P49662 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP4P49662 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP4P49662 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP4P49662 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP4P49662 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP4P49662 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP4P49662 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP4P49662 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP4P49662 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP4P49662 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP4P49662 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP4P49662 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP4P49662 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP4P49662 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP4P49662 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP4P49662 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP4P49662 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP4P49662 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP4P49662 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP4P49662 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP4P49662 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP4P49662 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP4P49662 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP4P49662 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP4P49662 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP4P49662 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP4P49662 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP4P49662 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP4P49662 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP4P49662 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP4P49662 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP4P49662 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP4P49662 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP4P49662 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP4P49662 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP4P49662 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP4P49662 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP4P49662 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP4P49662 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP4P49662 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP4P49662 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP4P49662 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP4P49662 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP4P49662 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP4P49662 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP4P49662 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP4P49662 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP4P49662 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP4P49662 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP4P49662 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP4P49662 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP4P49662 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP4P49662 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP4P49662 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP4P49662 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP4P49662 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP4P49662 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP4P49662 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP4P49662 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP4P49662 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP4P49662 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP4P49662 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP4P49662 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP4P49662 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP4P49662 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP4P49662 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP4P49662 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP4P49662 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP4P49662 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP4P49662 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP4P49662 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP4P49662 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP4P49662 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP4P49662 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP4P49662 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP4P49662 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP4P49662 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms