Protein–RNA interactions for Protein: P49585

PCYT1A, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1AP49585 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1AP49585 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCYT1AP49585 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCYT1AP49585 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1AP49585 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1AP49585 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCYT1AP49585 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1AP49585 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1AP49585 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1AP49585 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1AP49585 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1AP49585 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCYT1AP49585 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms