Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC11A1P49279 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC11A1P49279 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC11A1P49279 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC11A1P49279 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC11A1P49279 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC11A1P49279 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms