Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSSP48449 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSSP48449 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSSP48449 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSSP48449 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSSP48449 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSSP48449 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSSP48449 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LSSP48449 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LSSP48449 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LSSP48449 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSSP48449 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LSSP48449 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LSSP48449 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LSSP48449 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSSP48449 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSSP48449 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSSP48449 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSSP48449 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSSP48449 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSSP48449 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSSP48449 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSSP48449 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSSP48449 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSSP48449 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSSP48449 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSSP48449 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSSP48449 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LSSP48449 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSSP48449 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSSP48449 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSSP48449 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSSP48449 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSSP48449 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSSP48449 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSSP48449 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSSP48449 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSSP48449 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSSP48449 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSSP48449 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSSP48449 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSSP48449 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSSP48449 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSSP48449 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSSP48449 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSSP48449 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSSP48449 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSSP48449 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSSP48449 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSSP48449 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSSP48449 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSSP48449 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSSP48449 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSSP48449 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSSP48449 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSSP48449 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSSP48449 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSSP48449 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSSP48449 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSSP48449 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSSP48449 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSSP48449 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSSP48449 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSSP48449 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSSP48449 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSSP48449 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSSP48449 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSSP48449 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LSSP48449 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSSP48449 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSSP48449 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSSP48449 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSSP48449 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSSP48449 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSSP48449 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSSP48449 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSSP48449 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSSP48449 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSSP48449 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSSP48449 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSSP48449 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSSP48449 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSSP48449 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSSP48449 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSSP48449 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSSP48449 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSSP48449 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSSP48449 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSSP48449 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSSP48449 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSSP48449 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSSP48449 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSSP48449 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms