Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSN1S1P47710 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSN1S1P47710 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSN1S1P47710 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSN1S1P47710 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSN1S1P47710 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms