Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UTRNP46939 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UTRNP46939 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UTRNP46939 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
UTRNP46939 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UTRNP46939 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
UTRNP46939 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UTRNP46939 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
UTRNP46939 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
UTRNP46939 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
UTRNP46939 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
UTRNP46939 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
UTRNP46939 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UTRNP46939 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UTRNP46939 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UTRNP46939 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
UTRNP46939 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UTRNP46939 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UTRNP46939 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UTRNP46939 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
UTRNP46939 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UTRNP46939 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UTRNP46939 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
UTRNP46939 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UTRNP46939 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UTRNP46939 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UTRNP46939 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UTRNP46939 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UTRNP46939 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UTRNP46939 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
UTRNP46939 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UTRNP46939 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
UTRNP46939 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
UTRNP46939 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
UTRNP46939 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
UTRNP46939 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
UTRNP46939 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
UTRNP46939 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UTRNP46939 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
UTRNP46939 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
UTRNP46939 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UTRNP46939 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
UTRNP46939 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
UTRNP46939 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
UTRNP46939 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
UTRNP46939 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
UTRNP46939 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
UTRNP46939 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
UTRNP46939 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
UTRNP46939 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
UTRNP46939 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
UTRNP46939 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
UTRNP46939 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UTRNP46939 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
UTRNP46939 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UTRNP46939 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UTRNP46939 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
UTRNP46939 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
UTRNP46939 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UTRNP46939 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UTRNP46939 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
UTRNP46939 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
UTRNP46939 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
UTRNP46939 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
UTRNP46939 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
UTRNP46939 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
UTRNP46939 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
UTRNP46939 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UTRNP46939 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
UTRNP46939 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
UTRNP46939 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
UTRNP46939 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
UTRNP46939 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
UTRNP46939 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UTRNP46939 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
UTRNP46939 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
UTRNP46939 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
UTRNP46939 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
UTRNP46939 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
UTRNP46939 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
UTRNP46939 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
UTRNP46939 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
UTRNP46939 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
UTRNP46939 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
UTRNP46939 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
UTRNP46939 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
UTRNP46939 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
UTRNP46939 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
UTRNP46939 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
UTRNP46939 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
UTRNP46939 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
UTRNP46939 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
UTRNP46939 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
UTRNP46939 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
UTRNP46939 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
UTRNP46939 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
UTRNP46939 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
UTRNP46939 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
UTRNP46939 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
UTRNP46939 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms