Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPAR6P43657 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR6P43657 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR6P43657 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR6P43657 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR6P43657 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR6P43657 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LPAR6P43657 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPAR6P43657 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPAR6P43657 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LPAR6P43657 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPAR6P43657 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPAR6P43657 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPAR6P43657 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPAR6P43657 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPAR6P43657 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPAR6P43657 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPAR6P43657 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms