Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGCXP38435 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGCXP38435 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGCXP38435 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGCXP38435 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGCXP38435 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGCXP38435 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGCXP38435 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGCXP38435 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGCXP38435 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGCXP38435 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGCXP38435 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGCXP38435 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGCXP38435 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGCXP38435 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGCXP38435 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGCXP38435 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGCXP38435 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGCXP38435 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGCXP38435 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGCXP38435 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGCXP38435 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGCXP38435 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGCXP38435 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGCXP38435 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGCXP38435 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGCXP38435 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGCXP38435 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GGCXP38435 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGCXP38435 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGCXP38435 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGCXP38435 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GGCXP38435 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGCXP38435 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGCXP38435 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGCXP38435 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GGCXP38435 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GGCXP38435 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGCXP38435 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGCXP38435 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGCXP38435 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGCXP38435 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGCXP38435 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GGCXP38435 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGCXP38435 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGCXP38435 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GGCXP38435 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GGCXP38435 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGCXP38435 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GGCXP38435 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGCXP38435 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGCXP38435 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGCXP38435 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGCXP38435 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGCXP38435 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GGCXP38435 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGCXP38435 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGCXP38435 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGCXP38435 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGCXP38435 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GGCXP38435 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GGCXP38435 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GGCXP38435 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGCXP38435 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGCXP38435 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGCXP38435 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GGCXP38435 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGCXP38435 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GGCXP38435 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGCXP38435 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGCXP38435 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGCXP38435 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGCXP38435 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GGCXP38435 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGCXP38435 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGCXP38435 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GGCXP38435 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGCXP38435 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GGCXP38435 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGCXP38435 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGCXP38435 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GGCXP38435 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GGCXP38435 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GGCXP38435 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GGCXP38435 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms