Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP3P35625 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP3P35625 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMP3P35625 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP3P35625 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP3P35625 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP3P35625 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMP3P35625 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP3P35625 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms