Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA1P35221 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA1P35221 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA1P35221 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNA1P35221 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA1P35221 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA1P35221 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA1P35221 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA1P35221 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA1P35221 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNA1P35221 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA1P35221 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA1P35221 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA1P35221 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNA1P35221 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNA1P35221 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA1P35221 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA1P35221 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA1P35221 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNA1P35221 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA1P35221 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA1P35221 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTNNA1P35221 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CTNNA1P35221 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CTNNA1P35221 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNA1P35221 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNNA1P35221 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNA1P35221 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTNNA1P35221 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms