Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRA3P34903 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRA3P34903 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA3P34903 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABRA3P34903 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA3P34903 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms