Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP1P32455 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP1P32455 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP1P32455 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP1P32455 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP1P32455 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP1P32455 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP1P32455 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GBP1P32455 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP1P32455 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP1P32455 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP1P32455 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP1P32455 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP1P32455 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP1P32455 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP1P32455 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP1P32455 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP1P32455 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP1P32455 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP1P32455 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP1P32455 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP1P32455 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP1P32455 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP1P32455 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP1P32455 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP1P32455 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP1P32455 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP1P32455 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP1P32455 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP1P32455 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP1P32455 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP1P32455 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP1P32455 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP1P32455 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP1P32455 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP1P32455 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP1P32455 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP1P32455 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP1P32455 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP1P32455 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP1P32455 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP1P32455 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP1P32455 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GBP1P32455 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GBP1P32455 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP1P32455 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GBP1P32455 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP1P32455 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GBP1P32455 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP1P32455 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP1P32455 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP1P32455 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP1P32455 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP1P32455 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GBP1P32455 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP1P32455 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GBP1P32455 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GBP1P32455 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP1P32455 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GBP1P32455 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP1P32455 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP1P32455 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP1P32455 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP1P32455 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP1P32455 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GBP1P32455 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP1P32455 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP1P32455 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP1P32455 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GBP1P32455 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP1P32455 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP1P32455 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP1P32455 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP1P32455 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GBP1P32455 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP1P32455 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP1P32455 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP1P32455 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GBP1P32455 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP1P32455 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP1P32455 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GBP1P32455 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP1P32455 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GBP1P32455 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP1P32455 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP1P32455 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GBP1P32455 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GBP1P32455 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP1P32455 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP1P32455 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP1P32455 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP1P32455 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP1P32455 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP1P32455 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP1P32455 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP1P32455 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP1P32455 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP1P32455 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBP1P32455 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GBP1P32455 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms