Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YJR114WYJR114W 393 nt8.86□□□□□ -0.99
NDI1P32340 NPP1YCR026C 2229 nt8.86□□□□□ -0.99
NDI1P32340 GID8YMR135C 1368 nt8.86□□□□□ -0.99
NDI1P32340 DLD3YEL071W 1491 nt8.85□□□□□ -0.99
NDI1P32340 SPS100YHR139C 981 nt8.85□□□□□ -0.99
NDI1P32340 GID7YCL039W 2238 nt8.85□□□□□ -0.99
NDI1P32340 SAC7YDR389W 1965 nt8.84□□□□□ -0.99
NDI1P32340 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.84□□□□□ -0.99
NDI1P32340 POT1YIL160C 1254 nt8.84□□□□□ -0.99
NDI1P32340 PAU15YIR041W 375 nt8.84□□□□□ -0.99
NDI1P32340 ZAP1YJL056C 2643 nt8.84□□□□□ -0.99
NDI1P32340 TVP23YDR084C 600 nt8.82□□□□□ -1
NDI1P32340 YRF1-2YER190W 5046 nt8.81□□□□□ -1
NDI1P32340 YHR219WYHR219W 1875 nt8.79□□□□□ -1
NDI1P32340 YKL133CYKL133C 1392 nt8.79□□□□□ -1
NDI1P32340 YMR209CYMR209C 1374 nt8.79□□□□□ -1
NDI1P32340 OPI3YJR073C 621 nt8.79□□□□□ -1
NDI1P32340 GSF2YML048W 1212 nt8.79□□□□□ -1
NDI1P32340 YMR262WYMR262W 942 nt8.79□□□□□ -1
NDI1P32340 YNR064CYNR064C 873 nt8.79□□□□□ -1
NDI1P32340 MRS6YOR370C 1812 nt8.78□□□□□ -1
NDI1P32340 ACO2YJL200C 2370 nt8.78□□□□□ -1
NDI1P32340 ITR2YOL103W 1830 nt8.77□□□□□ -1
NDI1P32340 VMA11YPL234C 495 nt8.77□□□□□ -1.01
NDI1P32340 ABZ2YMR289W 1125 nt8.76□□□□□ -1.01
NDI1P32340 TUB4YLR212C 1422 nt8.75□□□□□ -1.01
NDI1P32340 CWP2YKL096W-A 279 nt8.74□□□□□ -1.01
NDI1P32340 RPD3YNL330C 1302 nt8.74□□□□□ -1.01
NDI1P32340 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.73□□□□□ -1.01
NDI1P32340 ESS1YJR017C 513 nt8.73□□□□□ -1.01
NDI1P32340 LSR1LSR1 1175 nt8.73□□□□□ -1.01
NDI1P32340 TIP1YBR067C 633 nt8.73□□□□□ -1.01
NDI1P32340 KEL3YPL263C 1956 nt8.72□□□□□ -1.01
NDI1P32340 PAU5YFL020C 369 nt8.72□□□□□ -1.01
NDI1P32340 STP3YLR375W 1032 nt8.72□□□□□ -1.01
NDI1P32340 SSL2YIL143C 2532 nt8.72□□□□□ -1.01
NDI1P32340 HMG2YLR450W 3138 nt8.71□□□□□ -1.01
NDI1P32340 NIF3YGL221C 867 nt8.71□□□□□ -1.02
NDI1P32340 ELO1YJL196C 933 nt8.71□□□□□ -1.02
NDI1P32340 KRR1YCL059C 951 nt8.7□□□□□ -1.02
NDI1P32340 PGC1YPL206C 966 nt8.7□□□□□ -1.02
NDI1P32340 YMR265CYMR265C 1386 nt8.7□□□□□ -1.02
NDI1P32340 APS2YJR058C 444 nt8.69□□□□□ -1.02
NDI1P32340 HAP5YOR358W 729 nt8.69□□□□□ -1.02
NDI1P32340 ODC1YPL134C 933 nt8.69□□□□□ -1.02
NDI1P32340 AMF1YOR378W 1548 nt8.69□□□□□ -1.02
NDI1P32340 RPN14YGL004C 1254 nt8.68□□□□□ -1.02
NDI1P32340 PCP1YGR101W 1041 nt8.68□□□□□ -1.02
NDI1P32340 ENO2YHR174W 1314 nt8.67□□□□□ -1.02
NDI1P32340 SNX3YOR357C 489 nt8.67□□□□□ -1.02
NDI1P32340 snR31snR31 225 nt8.67□□□□□ -1.02
NDI1P32340 PAR32YDL173W 888 nt8.66□□□□□ -1.02
NDI1P32340 TIM44YIL022W 1296 nt8.66□□□□□ -1.02
NDI1P32340 SWT21YNL187W 1074 nt8.66□□□□□ -1.02
NDI1P32340 YBR232CYBR232C 360 nt8.66□□□□□ -1.02
NDI1P32340 SUV3YPL029W 2214 nt8.66□□□□□ -1.02
NDI1P32340 TPO4YOR273C 1980 nt8.66□□□□□ -1.02
NDI1P32340 SFL1YOR140W 2301 nt8.63□□□□□ -1.03
NDI1P32340 RPC31YNL151C 756 nt8.62□□□□□ -1.03
NDI1P32340 MDM35YKL053C-A 261 nt8.61□□□□□ -1.03
NDI1P32340 LEU2YCL018W 1095 nt8.61□□□□□ -1.03
NDI1P32340 PSD1YNL169C 1503 nt8.6□□□□□ -1.03
NDI1P32340 TPC1YGR096W 945 nt8.6□□□□□ -1.03
NDI1P32340 FSH2YMR222C 672 nt8.6□□□□□ -1.03
NDI1P32340 KRE1YNL322C 942 nt8.6□□□□□ -1.03
NDI1P32340 MET1YKR069W 1782 nt8.6□□□□□ -1.03
NDI1P32340 DMA2YNL116W 1569 nt8.6□□□□□ -1.03
NDI1P32340 ESBP6YNL125C 2022 nt8.59□□□□□ -1.03
NDI1P32340 CRC1YOR100C 984 nt8.59□□□□□ -1.03
NDI1P32340 YHL008CYHL008C 1884 nt8.59□□□□□ -1.03
NDI1P32340 THP3YPR045C 1413 nt8.58□□□□□ -1.04
NDI1P32340 RIM2YBR192W 1134 nt8.57□□□□□ -1.04
NDI1P32340 NAS2YIL007C 663 nt8.56□□□□□ -1.04
NDI1P32340 SPE2YOL052C 1191 nt8.56□□□□□ -1.04
NDI1P32340 YHR218WYHR218W 1812 nt8.55□□□□□ -1.04
NDI1P32340 IGD1YFR017C 588 nt8.55□□□□□ -1.04
NDI1P32340 SEN2YLR105C 1134 nt8.54□□□□□ -1.04
NDI1P32340 CDD1YLR245C 429 nt8.54□□□□□ -1.04
NDI1P32340 URA8YJR103W 1737 nt8.54□□□□□ -1.04
NDI1P32340 NAM8YHR086W 1572 nt8.53□□□□□ -1.04
NDI1P32340 ILV2YMR108W 2064 nt8.53□□□□□ -1.04
NDI1P32340 DPL1YDR294C 1770 nt8.53□□□□□ -1.04
NDI1P32340 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.52□□□□□ -1.05
NDI1P32340 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.52□□□□□ -1.05
NDI1P32340 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.52□□□□□ -1.05
NDI1P32340 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.52□□□□□ -1.05
NDI1P32340 YKL053WYKL053W 375 nt8.52□□□□□ -1.05
NDI1P32340 NAP1YKR048C 1254 nt8.51□□□□□ -1.05
NDI1P32340 CYT1YOR065W 930 nt8.51□□□□□ -1.05
NDI1P32340 RFC1YOR217W 2586 nt8.51□□□□□ -1.05
NDI1P32340 SRP54YPR088C 1626 nt8.5□□□□□ -1.05
NDI1P32340 SAN1YDR143C 1833 nt8.5□□□□□ -1.05
NDI1P32340 KGD2YDR148C 1392 nt8.49□□□□□ -1.05
NDI1P32340 GTB1YDR221W 2109 nt8.49□□□□□ -1.05
NDI1P32340 REX2YLR059C 810 nt8.49□□□□□ -1.05
NDI1P32340 SBP1YHL034C 885 nt8.47□□□□□ -1.05
NDI1P32340 YJL064WYJL064W 396 nt8.47□□□□□ -1.05
NDI1P32340 INH1YDL181W 258 nt8.46□□□□□ -1.06
NDI1P32340 YKR012CYKR012C 378 nt8.46□□□□□ -1.06
NDI1P32340 HXT10YFL011W 1641 nt8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.9 ms