Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
L1CAMP32004 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
L1CAMP32004 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1CAMP32004 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1CAMP32004 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms