Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCND3P30281 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCND3P30281 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCND3P30281 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCND3P30281 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCND3P30281 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCND3P30281 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCND3P30281 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCND3P30281 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCND3P30281 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCND3P30281 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCND3P30281 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCND3P30281 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCND3P30281 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCND3P30281 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCND3P30281 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCND3P30281 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCND3P30281 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCND3P30281 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCND3P30281 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCND3P30281 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCND3P30281 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCND3P30281 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCND3P30281 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCND3P30281 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCND3P30281 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCND3P30281 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCND3P30281 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCND3P30281 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCND3P30281 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCND3P30281 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCND3P30281 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCND3P30281 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCND3P30281 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCND3P30281 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCND3P30281 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCND3P30281 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCND3P30281 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCND3P30281 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCND3P30281 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCND3P30281 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCND3P30281 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCND3P30281 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCND3P30281 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCND3P30281 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCND3P30281 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCND3P30281 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCND3P30281 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCND3P30281 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCND3P30281 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCND3P30281 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCND3P30281 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCND3P30281 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCND3P30281 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.37
CCND3P30281 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCND3P30281 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCND3P30281 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCND3P30281 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCND3P30281 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCND3P30281 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCND3P30281 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCND3P30281 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCND3P30281 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCND3P30281 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCND3P30281 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCND3P30281 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCND3P30281 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCND3P30281 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCND3P30281 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCND3P30281 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCND3P30281 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCND3P30281 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCND3P30281 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCND3P30281 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCND3P30281 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCND3P30281 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCND3P30281 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCND3P30281 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCND3P30281 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCND3P30281 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCND3P30281 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCND3P30281 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCND3P30281 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCND3P30281 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCND3P30281 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCND3P30281 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCND3P30281 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCND3P30281 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCND3P30281 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCND3P30281 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCND3P30281 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCND3P30281 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms