Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP5DP30049 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP5DP30049 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP5DP30049 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP5DP30049 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP5DP30049 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP5DP30049 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP5DP30049 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms