Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5AP29375 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5AP29375 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5AP29375 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5AP29375 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
KDM5AP29375 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5AP29375 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
KDM5AP29375 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5AP29375 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
KDM5AP29375 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
KDM5AP29375 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
KDM5AP29375 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5AP29375 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
KDM5AP29375 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
KDM5AP29375 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
KDM5AP29375 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5AP29375 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
KDM5AP29375 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5AP29375 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
KDM5AP29375 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
KDM5AP29375 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
KDM5AP29375 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
KDM5AP29375 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5AP29375 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
KDM5AP29375 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5AP29375 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms