Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPL13P26373 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPL13P26373 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPL13P26373 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPL13P26373 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPL13P26373 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPL13P26373 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPL13P26373 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPL13P26373 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPL13P26373 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPL13P26373 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPL13P26373 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPL13P26373 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPL13P26373 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPL13P26373 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPL13P26373 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPL13P26373 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPL13P26373 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPL13P26373 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPL13P26373 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPL13P26373 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPL13P26373 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPL13P26373 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPL13P26373 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPL13P26373 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPL13P26373 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RPL13P26373 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL13P26373 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL13P26373 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL13P26373 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPL13P26373 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPL13P26373 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPL13P26373 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPL13P26373 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPL13P26373 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPL13P26373 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPL13P26373 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPL13P26373 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPL13P26373 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPL13P26373 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPL13P26373 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RPL13P26373 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RPL13P26373 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPL13P26373 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPL13P26373 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPL13P26373 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPL13P26373 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPL13P26373 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPL13P26373 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPL13P26373 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPL13P26373 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPL13P26373 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPL13P26373 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPL13P26373 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPL13P26373 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPL13P26373 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPL13P26373 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPL13P26373 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPL13P26373 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPL13P26373 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPL13P26373 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPL13P26373 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPL13P26373 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPL13P26373 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPL13P26373 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPL13P26373 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPL13P26373 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPL13P26373 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPL13P26373 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPL13P26373 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPL13P26373 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPL13P26373 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPL13P26373 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPL13P26373 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPL13P26373 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPL13P26373 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPL13P26373 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPL13P26373 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL13P26373 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL13P26373 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL13P26373 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL13P26373 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL13P26373 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL13P26373 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL13P26373 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPL13P26373 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RPL13P26373 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPL13P26373 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPL13P26373 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPL13P26373 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPL13P26373 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPL13P26373 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPL13P26373 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPL13P26373 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPL13P26373 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPL13P26373 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPL13P26373 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPL13P26373 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPL13P26373 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPL13P26373 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms