Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSSP25774 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSSP25774 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSSP25774 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSSP25774 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSSP25774 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSSP25774 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSSP25774 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSSP25774 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSSP25774 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSSP25774 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSSP25774 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSSP25774 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSSP25774 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSSP25774 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSSP25774 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSSP25774 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTSSP25774 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSSP25774 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSSP25774 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSSP25774 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSSP25774 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSSP25774 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSSP25774 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSSP25774 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSSP25774 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSSP25774 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSSP25774 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSSP25774 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSSP25774 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSSP25774 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSSP25774 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSSP25774 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSSP25774 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSSP25774 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSSP25774 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSSP25774 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSSP25774 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSSP25774 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSSP25774 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSSP25774 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSSP25774 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSSP25774 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSSP25774 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSSP25774 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSSP25774 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSSP25774 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSSP25774 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSSP25774 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSSP25774 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSSP25774 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSSP25774 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSSP25774 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSSP25774 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSSP25774 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSSP25774 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSSP25774 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSSP25774 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSSP25774 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSSP25774 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSSP25774 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSSP25774 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSSP25774 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSSP25774 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSSP25774 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSSP25774 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSSP25774 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSSP25774 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSSP25774 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSSP25774 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSSP25774 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSSP25774 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSSP25774 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSSP25774 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSSP25774 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSSP25774 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSSP25774 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSSP25774 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSSP25774 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSSP25774 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSSP25774 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSSP25774 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSSP25774 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSSP25774 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTSSP25774 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSSP25774 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTSSP25774 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSSP25774 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSSP25774 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTSSP25774 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSSP25774 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSSP25774 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTSSP25774 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSSP25774 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSSP25774 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSSP25774 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSSP25774 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSSP25774 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSSP25774 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTSSP25774 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms