Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND1P24385 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND1P24385 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND1P24385 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND1P24385 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND1P24385 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND1P24385 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND1P24385 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND1P24385 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND1P24385 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND1P24385 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND1P24385 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND1P24385 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND1P24385 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCND1P24385 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCND1P24385 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCND1P24385 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCND1P24385 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCND1P24385 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCND1P24385 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCND1P24385 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCND1P24385 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCND1P24385 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCND1P24385 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCND1P24385 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCND1P24385 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCND1P24385 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCND1P24385 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCND1P24385 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCND1P24385 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCND1P24385 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCND1P24385 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCND1P24385 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCND1P24385 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCND1P24385 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCND1P24385 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCND1P24385 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCND1P24385 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCND1P24385 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCND1P24385 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCND1P24385 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCND1P24385 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCND1P24385 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCND1P24385 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCND1P24385 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCND1P24385 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND1P24385 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND1P24385 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND1P24385 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND1P24385 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND1P24385 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND1P24385 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND1P24385 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND1P24385 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND1P24385 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND1P24385 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND1P24385 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND1P24385 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND1P24385 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND1P24385 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND1P24385 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND1P24385 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND1P24385 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND1P24385 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCND1P24385 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND1P24385 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND1P24385 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND1P24385 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND1P24385 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND1P24385 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND1P24385 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND1P24385 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND1P24385 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND1P24385 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND1P24385 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND1P24385 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND1P24385 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND1P24385 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND1P24385 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND1P24385 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND1P24385 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND1P24385 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND1P24385 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND1P24385 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND1P24385 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND1P24385 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND1P24385 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND1P24385 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND1P24385 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND1P24385 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND1P24385 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND1P24385 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCND1P24385 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCND1P24385 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND1P24385 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND1P24385 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND1P24385 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND1P24385 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND1P24385 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND1P24385 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms