Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCEA1P23193 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCEA1P23193 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCEA1P23193 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCEA1P23193 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TCEA1P23193 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCEA1P23193 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms