Protein–RNA interactions for Protein: P22681

CBL, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLP22681 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBLP22681 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLP22681 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLP22681 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLP22681 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLP22681 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBLP22681 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLP22681 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLP22681 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLP22681 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLP22681 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLP22681 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLP22681 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBLP22681 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBLP22681 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBLP22681 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBLP22681 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBLP22681 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBLP22681 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CBLP22681 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBLP22681 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBLP22681 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBLP22681 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLP22681 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLP22681 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBLP22681 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBLP22681 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBLP22681 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLP22681 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLP22681 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLP22681 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLP22681 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBLP22681 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLP22681 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLP22681 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLP22681 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLP22681 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBLP22681 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBLP22681 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBLP22681 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBLP22681 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBLP22681 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLP22681 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLP22681 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBLP22681 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLP22681 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLP22681 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLP22681 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLP22681 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBLP22681 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLP22681 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLP22681 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLP22681 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLP22681 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CBLP22681 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLP22681 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLP22681 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBLP22681 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLP22681 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBLP22681 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBLP22681 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBLP22681 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBLP22681 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLP22681 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLP22681 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBLP22681 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLP22681 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBLP22681 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLP22681 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBLP22681 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLP22681 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLP22681 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLP22681 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLP22681 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLP22681 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBLP22681 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBLP22681 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBLP22681 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBLP22681 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLP22681 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLP22681 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLP22681 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLP22681 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLP22681 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CBLP22681 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLP22681 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBLP22681 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBLP22681 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBLP22681 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBLP22681 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBLP22681 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBLP22681 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLP22681 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLP22681 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLP22681 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBLP22681 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLP22681 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBLP22681 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLP22681 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBLP22681 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms