Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX1P22670 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX1P22670 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX1P22670 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX1P22670 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX1P22670 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX1P22670 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX1P22670 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX1P22670 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX1P22670 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX1P22670 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX1P22670 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX1P22670 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX1P22670 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX1P22670 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX1P22670 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX1P22670 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX1P22670 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX1P22670 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX1P22670 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX1P22670 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX1P22670 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX1P22670 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX1P22670 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX1P22670 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX1P22670 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX1P22670 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX1P22670 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX1P22670 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFX1P22670 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFX1P22670 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFX1P22670 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX1P22670 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX1P22670 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX1P22670 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX1P22670 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX1P22670 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX1P22670 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX1P22670 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX1P22670 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX1P22670 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX1P22670 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX1P22670 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX1P22670 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFX1P22670 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX1P22670 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFX1P22670 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX1P22670 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX1P22670 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX1P22670 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFX1P22670 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFX1P22670 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFX1P22670 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFX1P22670 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFX1P22670 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX1P22670 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX1P22670 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFX1P22670 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX1P22670 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX1P22670 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFX1P22670 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX1P22670 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX1P22670 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX1P22670 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX1P22670 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFX1P22670 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX1P22670 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFX1P22670 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX1P22670 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFX1P22670 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX1P22670 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX1P22670 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFX1P22670 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX1P22670 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX1P22670 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX1P22670 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RFX1P22670 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFX1P22670 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX1P22670 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX1P22670 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX1P22670 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX1P22670 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFX1P22670 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX1P22670 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFX1P22670 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX1P22670 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX1P22670 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFX1P22670 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFX1P22670 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX1P22670 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX1P22670 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX1P22670 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX1P22670 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX1P22670 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX1P22670 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFX1P22670 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFX1P22670 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFX1P22670 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFX1P22670 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFX1P22670 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms