Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGFR3P22607 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGFR3P22607 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGFR3P22607 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGFR3P22607 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR3P22607 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGFR3P22607 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGFR3P22607 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.9 ms