Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PDCP20941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCP20941 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCP20941 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCP20941 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCP20941 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCP20941 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCP20941 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCP20941 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCP20941 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCP20941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDCP20941 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PDCP20941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDCP20941 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDCP20941 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDCP20941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDCP20941 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDCP20941 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDCP20941 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCP20941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCP20941 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCP20941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDCP20941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDCP20941 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDCP20941 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDCP20941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDCP20941 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDCP20941 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDCP20941 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCP20941 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCP20941 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCP20941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCP20941 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDCP20941 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDCP20941 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDCP20941 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDCP20941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDCP20941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDCP20941 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDCP20941 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDCP20941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PDCP20941 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCP20941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCP20941 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCP20941 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCP20941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCP20941 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCP20941 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCP20941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDCP20941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDCP20941 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCP20941 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCP20941 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCP20941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PDCP20941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDCP20941 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDCP20941 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCP20941 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCP20941 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PDCP20941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDCP20941 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PDCP20941 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCP20941 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCP20941 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCP20941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCP20941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDCP20941 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDCP20941 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDCP20941 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDCP20941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDCP20941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDCP20941 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDCP20941 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDCP20941 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCP20941 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDCP20941 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCP20941 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCP20941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCP20941 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCP20941 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCP20941 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCP20941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCP20941 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PDCP20941 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCP20941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCP20941 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDCP20941 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDCP20941 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDCP20941 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCP20941 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCP20941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCP20941 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDCP20941 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDCP20941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCP20941 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCP20941 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCP20941 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCP20941 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCP20941 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCP20941 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms