Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA1P20827 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA1P20827 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA1P20827 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA1P20827 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFNA1P20827 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms