Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB1P20618 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB1P20618 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB1P20618 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB1P20618 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB1P20618 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms