Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMY2BP19961 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMY2BP19961 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMY2BP19961 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2BP19961 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380.3 ms