Protein–RNA interactions for Protein: P19438

TNFRSF1A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1AP19438 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1AP19438 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1AP19438 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1AP19438 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1AP19438 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1AP19438 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1AP19438 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF1AP19438 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF1AP19438 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF1AP19438 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1AP19438 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1AP19438 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1AP19438 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms