Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT4P19013 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT4P19013 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT4P19013 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT4P19013 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT4P19013 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT4P19013 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT4P19013 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT4P19013 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT4P19013 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT4P19013 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT4P19013 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT4P19013 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT4P19013 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT4P19013 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT4P19013 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT4P19013 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT4P19013 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT4P19013 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT4P19013 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT4P19013 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT4P19013 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT4P19013 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT4P19013 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT4P19013 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT4P19013 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT4P19013 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT4P19013 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT4P19013 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT4P19013 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT4P19013 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT4P19013 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT4P19013 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT4P19013 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT4P19013 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT4P19013 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT4P19013 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT4P19013 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT4P19013 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT4P19013 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT4P19013 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT4P19013 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT4P19013 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT4P19013 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT4P19013 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT4P19013 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT4P19013 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT4P19013 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT4P19013 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT4P19013 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT4P19013 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT4P19013 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT4P19013 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT4P19013 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT4P19013 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT4P19013 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT4P19013 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT4P19013 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT4P19013 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT4P19013 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT4P19013 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT4P19013 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT4P19013 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT4P19013 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT4P19013 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT4P19013 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT4P19013 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT4P19013 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT4P19013 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT4P19013 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT4P19013 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT4P19013 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT4P19013 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT4P19013 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT4P19013 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT4P19013 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT4P19013 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT4P19013 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT4P19013 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT4P19013 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT4P19013 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT4P19013 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT4P19013 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT4P19013 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT4P19013 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT4P19013 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT4P19013 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT4P19013 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT4P19013 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT4P19013 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT4P19013 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT4P19013 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT4P19013 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT4P19013 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT4P19013 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT4P19013 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT4P19013 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT4P19013 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT4P19013 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT4P19013 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms