Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF1P18846 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF1P18846 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF1P18846 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF1P18846 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF1P18846 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF1P18846 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF1P18846 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF1P18846 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF1P18846 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF1P18846 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF1P18846 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF1P18846 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF1P18846 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF1P18846 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF1P18846 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF1P18846 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF1P18846 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF1P18846 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF1P18846 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF1P18846 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF1P18846 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF1P18846 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF1P18846 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF1P18846 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF1P18846 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF1P18846 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF1P18846 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF1P18846 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF1P18846 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF1P18846 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF1P18846 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF1P18846 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF1P18846 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF1P18846 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF1P18846 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF1P18846 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF1P18846 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF1P18846 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF1P18846 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF1P18846 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF1P18846 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF1P18846 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF1P18846 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF1P18846 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF1P18846 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF1P18846 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF1P18846 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF1P18846 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF1P18846 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF1P18846 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF1P18846 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF1P18846 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF1P18846 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF1P18846 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF1P18846 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF1P18846 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF1P18846 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF1P18846 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF1P18846 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF1P18846 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF1P18846 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF1P18846 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF1P18846 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF1P18846 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF1P18846 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF1P18846 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF1P18846 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF1P18846 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF1P18846 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF1P18846 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF1P18846 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF1P18846 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF1P18846 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF1P18846 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF1P18846 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF1P18846 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF1P18846 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF1P18846 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF1P18846 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF1P18846 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF1P18846 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF1P18846 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF1P18846 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF1P18846 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF1P18846 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF1P18846 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF1P18846 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF1P18846 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF1P18846 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF1P18846 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF1P18846 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF1P18846 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF1P18846 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF1P18846 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF1P18846 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF1P18846 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF1P18846 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF1P18846 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF1P18846 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms