Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1P18754 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1P18754 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1P18754 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC1P18754 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC1P18754 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC1P18754 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC1P18754 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC1P18754 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC1P18754 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC1P18754 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC1P18754 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC1P18754 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC1P18754 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC1P18754 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC1P18754 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC1P18754 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC1P18754 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC1P18754 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCC1P18754 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RCC1P18754 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC1P18754 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC1P18754 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC1P18754 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC1P18754 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC1P18754 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC1P18754 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC1P18754 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC1P18754 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC1P18754 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC1P18754 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCC1P18754 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCC1P18754 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCC1P18754 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC1P18754 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC1P18754 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC1P18754 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC1P18754 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCC1P18754 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCC1P18754 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCC1P18754 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCC1P18754 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RCC1P18754 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCC1P18754 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCC1P18754 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCC1P18754 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCC1P18754 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RCC1P18754 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCC1P18754 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCC1P18754 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCC1P18754 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCC1P18754 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RCC1P18754 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCC1P18754 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCC1P18754 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCC1P18754 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCC1P18754 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCC1P18754 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCC1P18754 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCC1P18754 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCC1P18754 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCC1P18754 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCC1P18754 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCC1P18754 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCC1P18754 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCC1P18754 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCC1P18754 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCC1P18754 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCC1P18754 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCC1P18754 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCC1P18754 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCC1P18754 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCC1P18754 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RCC1P18754 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCC1P18754 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCC1P18754 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCC1P18754 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCC1P18754 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCC1P18754 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCC1P18754 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RCC1P18754 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCC1P18754 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCC1P18754 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCC1P18754 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCC1P18754 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCC1P18754 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCC1P18754 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCC1P18754 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RCC1P18754 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCC1P18754 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCC1P18754 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms