Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCLP18206 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCLP18206 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCLP18206 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCLP18206 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCLP18206 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCLP18206 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCLP18206 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCLP18206 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VCLP18206 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCLP18206 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCLP18206 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCLP18206 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCLP18206 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VCLP18206 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCLP18206 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCLP18206 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCLP18206 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCLP18206 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCLP18206 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCLP18206 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCLP18206 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCLP18206 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCLP18206 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCLP18206 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCLP18206 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCLP18206 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCLP18206 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCLP18206 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCLP18206 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCLP18206 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCLP18206 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCLP18206 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCLP18206 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCLP18206 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCLP18206 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCLP18206 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCLP18206 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCLP18206 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCLP18206 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCLP18206 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCLP18206 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCLP18206 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCLP18206 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCLP18206 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCLP18206 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCLP18206 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VCLP18206 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCLP18206 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCLP18206 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCLP18206 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCLP18206 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VCLP18206 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCLP18206 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCLP18206 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCLP18206 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCLP18206 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCLP18206 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VCLP18206 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCLP18206 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCLP18206 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCLP18206 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCLP18206 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCLP18206 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VCLP18206 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VCLP18206 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCLP18206 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCLP18206 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCLP18206 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCLP18206 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCLP18206 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCLP18206 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCLP18206 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCLP18206 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCLP18206 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCLP18206 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCLP18206 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCLP18206 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCLP18206 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCLP18206 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCLP18206 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCLP18206 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCLP18206 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCLP18206 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCLP18206 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCLP18206 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCLP18206 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCLP18206 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCLP18206 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCLP18206 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCLP18206 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCLP18206 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCLP18206 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms