Protein–RNA interactions for Protein: P17568

NDUFB7, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB7P17568 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB7P17568 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFB7P17568 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFB7P17568 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFB7P17568 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms