Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB8P17481 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXB8P17481 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXB8P17481 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB8P17481 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB8P17481 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB8P17481 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB8P17481 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms