Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF2P15336 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF2P15336 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF2P15336 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATF2P15336 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF2P15336 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATF2P15336 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATF2P15336 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATF2P15336 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF2P15336 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF2P15336 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF2P15336 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF2P15336 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF2P15336 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATF2P15336 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF2P15336 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF2P15336 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATF2P15336 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF2P15336 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF2P15336 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF2P15336 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF2P15336 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF2P15336 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF2P15336 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF2P15336 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF2P15336 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF2P15336 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF2P15336 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF2P15336 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF2P15336 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF2P15336 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF2P15336 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF2P15336 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF2P15336 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF2P15336 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF2P15336 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF2P15336 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF2P15336 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF2P15336 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF2P15336 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF2P15336 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF2P15336 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF2P15336 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF2P15336 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF2P15336 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF2P15336 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF2P15336 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF2P15336 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF2P15336 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF2P15336 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF2P15336 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF2P15336 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF2P15336 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF2P15336 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF2P15336 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF2P15336 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF2P15336 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF2P15336 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF2P15336 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF2P15336 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF2P15336 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF2P15336 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF2P15336 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF2P15336 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF2P15336 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF2P15336 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF2P15336 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF2P15336 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF2P15336 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF2P15336 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF2P15336 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF2P15336 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF2P15336 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF2P15336 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF2P15336 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF2P15336 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF2P15336 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF2P15336 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF2P15336 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF2P15336 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF2P15336 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF2P15336 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF2P15336 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF2P15336 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF2P15336 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF2P15336 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF2P15336 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATF2P15336 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF2P15336 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF2P15336 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF2P15336 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATF2P15336 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATF2P15336 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms