Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2F2P13984 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2F2P13984 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2F2P13984 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2F2P13984 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2F2P13984 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms