Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX4I1P13073 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX4I1P13073 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX4I1P13073 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COX4I1P13073 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COX4I1P13073 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms