Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEPDP12955 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEPDP12955 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEPDP12955 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEPDP12955 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEPDP12955 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEPDP12955 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEPDP12955 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEPDP12955 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEPDP12955 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEPDP12955 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEPDP12955 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEPDP12955 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEPDP12955 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEPDP12955 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEPDP12955 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEPDP12955 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEPDP12955 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEPDP12955 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEPDP12955 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEPDP12955 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEPDP12955 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEPDP12955 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEPDP12955 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEPDP12955 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEPDP12955 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEPDP12955 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEPDP12955 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEPDP12955 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEPDP12955 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEPDP12955 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEPDP12955 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEPDP12955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEPDP12955 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEPDP12955 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEPDP12955 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEPDP12955 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEPDP12955 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEPDP12955 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEPDP12955 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PEPDP12955 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEPDP12955 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEPDP12955 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEPDP12955 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEPDP12955 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEPDP12955 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEPDP12955 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEPDP12955 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEPDP12955 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEPDP12955 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEPDP12955 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PEPDP12955 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEPDP12955 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEPDP12955 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEPDP12955 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEPDP12955 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEPDP12955 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEPDP12955 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEPDP12955 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEPDP12955 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEPDP12955 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEPDP12955 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEPDP12955 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEPDP12955 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEPDP12955 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEPDP12955 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEPDP12955 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEPDP12955 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEPDP12955 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEPDP12955 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEPDP12955 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEPDP12955 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEPDP12955 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEPDP12955 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEPDP12955 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEPDP12955 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEPDP12955 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEPDP12955 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEPDP12955 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEPDP12955 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEPDP12955 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEPDP12955 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEPDP12955 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEPDP12955 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEPDP12955 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEPDP12955 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEPDP12955 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEPDP12955 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEPDP12955 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEPDP12955 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEPDP12955 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEPDP12955 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEPDP12955 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms